虽然尤里仍然在侏罗纪和他的恐龙朋友们一起“玩”，但是心灵军团仍然能占领莫斯科，并且开始四处扩张。对我们首都的突然袭击，已经使我们失尽先机，并且我军还遇到了前所未有的技术――心灵阻断技术，我们的核子反应炉被隐形部队破坏了，然后在我军雷达瘫痪时，心灵军团的隐形坦克集群包围了克里姆林宫并俘虏了总理，总理在被俘虏前发出了撤退至乌拉尔山脉的命令
莫斯科的幸存部队正赶往乌拉尔山的4G补给基地，我们的侦察机已经在该基地附近发现了一个小型心灵军团营地。我们的敌人正在追击我们，我们必须尽快赶到乌拉尔山，并且通知并警告其他幸存的苏联部队